Ion新成果Gut杂志NGS法鉴

喜讯

匹兹堡大学医学中心的研究人员新开发出一项基于新一代测序（NGS）的检测方法，帮助临床医生通过鉴别囊肿液DNA突变发现癌性胰腺囊肿。此项研究发表在最新的《Gut》杂志上。

约15%的胰腺癌从常见的胰腺囊肿发展而来，但目前尚无良好方法区分良性和癌性囊肿。9月18日UPMC的外科病理医师AaturSinghi和他的团队在《Gut》杂志上发表了一项新开发的靶向新一代测序检测方法，只需从胰腺囊肿中取得少量液体来检测与胰腺癌相关的10种基因突变，从而鉴定囊肿是良性还是癌性。

这是第一个前瞻性研究，旨在手术前检查胰腺囊肿，而不像之前在手术后对胰腺囊肿进行病理分析。该方法比其他基于形态学的方法更为灵敏，将有助于指导医师确定哪些患者需要手术，如果在胰腺癌症状出现之前能将囊肿切除掉，将会大大提高患者的生存率。

▼

研究的leadauthorAaturSinghi表示，该项研究的目的是实现对胰腺癌的早期诊断，提高胰腺癌患者的存活率。“通常胰腺癌发现时就已经到了晚期，”Singhi说，约有85%的胰腺癌患者是在已经患有局部晚期或转移性胰腺癌之后才被诊断出来的，因此五年生存率很低只有9%。

大多数情况下囊肿为良性，但是有些胰腺囊肿可以发展成为胰腺癌，胰腺囊肿通常是在其他适应证而进行核磁共振成像（MRI）检查时偶然发现的，目前通常是依靠超声内镜引导下的细针穿刺活检来检测胰腺囊肿的良性还是恶性，这种检测方法只有58%的准确度，活检和其他成像检查检测胰腺囊肿的灵敏度通常也低于50%，这往往会导致可怕的后果。不仅会严重耽搁早期胰腺癌的发现和治疗，而且不准确的诊断还会让患者承受不必要的手术。

Singhi估计约有-万的美国人患有胰腺囊肿，其中大部分是良性囊肿。手术切除可能会产生各种严重的并发症：多达4%的患者在手术后90天内死亡，30-40%的患者会受到长期持续影响，包括早发性糖尿病、胰腺炎、失去对某类食物的消化能力以及慢性疼痛。由于胰腺囊肿较为常见且手术切除可能导致严重的后果，因此，寻找一种能够区分癌性囊肿和良性囊肿的有效方法非常重要。

▼

最近，基于DNA的分子检测已开始应用于该领域，Singhi认为基于新一代测序（NGS）的分子检测方法可能更加灵敏。

研究人员在研究中设计了一个靶向测序实验，使用超声内镜—细针穿刺获得了例患者的例胰腺囊肿液样本，通过对已知与胰腺癌相关的10个基因进行靶向测序。KRAS或GNAS基因突变与两种癌前囊肿——胰腺导管内乳头状粘液性肿瘤和黏液性囊性肿瘤是高度特异，而TP53、PIK3CA和PTEN基因突变则与晚期恶性肿瘤相关。

研究人员使用ThermoFisherScientific的IonPGMIonProton进行高通量测序，并用TorrentSuiteSoftwareV.3.4.2进行分析。

结果显示，例囊肿样本中鉴定到KRAS或GNAS突变，35例鉴定到TP53、PTEN、PIK3CA或AKT1突变。基于例接受手术患者的随访数据，研究人员能够确定这些基因的等位基因频率阈值，从而确定囊肿是否为癌性：总体灵敏度达到89%，特异性达到%。相比之下，其他非分子方法的灵敏度仅有42%或更低，特异性为74%-98%。

研究人员还在IonTorrent平台上设计了Assay，能够以x的测序深度识别出低至3%的低频等位基因突变。分子检测已经成为胰腺囊肿鉴定的辅助手段。

最后，Singhi表示，研究人员希望进一步完善这项检测，以便能够鉴定出已经在向癌症转变的胰腺囊肿。“我们希望将该检测拓展成为风险分级检测，”他说，通过检测确定患者的囊肿存在癌变风险，从而根据情况提前进行监测。

*本文封面及部分配图来自视觉中国，如因版权等有疑问，请于本文刊发后30日内联系本账户

赞赏

长按







































北京看白癜风比较好的医院
北京中科皮肤病医院