胰腺癌患者十二指肠液菌群变化

年末促销倒计时：4天

百迈客推出年末活动促销，发文有礼、推广有礼以及多种产品钜惠来袭，百迈客为您倾情打造科研福利，您还在等什么？快快行动起来领取您的超级奖励吧！（详情请见“决战00！品类全，力度大，仅此一次！”）

导读

背景与目的：胰腺导管腺癌（PDAC）患者的肿瘤微生物群落包括正常存在于上消化道的细菌。如果PDAC患者肿瘤内细菌的主要来源是从十二指肠逆行迁移，因此十二指肠液可以作为确定PDAC患者或PDAC发病风险的微生物组特征的代表性生物标记。

方法：本文进行了一项针对名接受十二指肠内镜检测的患者细菌和真菌（16S和18S）的病例-对照研究，包括名正常胰腺对照，98名胰腺囊肿和74名PDAC患者。结果：十二指肠液微生物改变与Alpha多样性降低与年龄大于70及质子泵抑制剂的使用显著相关。与年龄相匹配的正常胰腺和胰腺囊肿对照组相比，PDAC患者的十二指肠微生物α多样性显著降低。有证据表明，与对照组和胰腺囊肿患者相比，PDAC患者的十二指肠液中Bifidobacterium富集。短期存活的PDAC患者的十二指肠中Fusobacteria和Rothia富集。十二指肠液微生物组在对照组和胰腺囊肿患者之间没有显著差异。结论：与胰腺囊肿患者和正常胰腺人群相比，PDAC患者的十二指肠液微生物组有改变。

中文题目：胰腺癌患者十二指肠液菌群变化

英文题目：Alterationsintheduodenalfluidmicrobiomeofpatientswithpancreaticcancer期刊：ClinicalGastroenterologyandHepatologyIF：8.发表时间：00.11.4作者：ShiroKohi单位：约翰霍普金斯医学院癌症研究中心

材料与方法

实验材料：名受试者：名健康对照、98名胰腺囊肿和74名PDAC患者。

实验方法：16SV3-4rRNA测序和ITS1测序。

实验结果

1、正常胰腺对照组十二指肠微生物组成门水平相对丰度大于1%的有Firmicutes、Bacteroidetes、Proteobacteria、Actinobacteria、Fusobacteria、Patescibacteria和Epsilonbacteraeota。作者发现经常使用PPI与十二指肠微生物组的变化有关。PPI使用者的Alpha多样性指数（observedOTUs、ShannonIndex和FaithPD）显著低于PPI未使用者（图1A）。属水平分析和LEfSe分析显示Streptococcus显著富集于PPI使用者（图1B和C）。图1PPI使用者和未使用者十二指肠液微生物、PDAC患者与正常胰腺对照十二指肠微生物比较与正常胰腺对照组相比，PDAC患者更易患糖尿病和胆道阻塞及PPI的使用频率（表1）。与正常胰腺对照组相比，PDAC患者的十二指肠液细菌DNA水平更高（图A）。与正常胰腺对照组相比，PDAC患者Alpha多样性指数（observedOTUs、ShannonIndex和FaithPD）显著降低（图B）。非加权beta多样性分析显示PDAC患者与正常胰腺对照组菌群结构差异显著（图C和D）。PDAC患者Fusobacteria丰度高，经过多次比较发现差异不大（图D和E）。属水平，PDAC患Fusobacterium、Enterococcus和Bifidobacterium丰度高于对照组。LEfSe分析显示Enterococcaceae、Lactobacillaceae和Bifidobacteriaceae富集在PDAC患者中（图F）。图PDAC患者和正常胰腺对照十二指肠液细菌群落比较表1患者特征：PDACvs正常胰腺3、PDAC患者与胰腺囊肿患者十二指肠微生物比较作者比较了年龄相匹配的PDAC患者和胰腺囊肿患者的十二指肠细菌微生物群落（表和图3）。与胰腺囊肿患者相比，PDAC患者的Alpha多样性显著降低（图3B）。Beta多样性分析也显示菌群结构显著差异（图3C）。PDAC患者十二指肠液中Escherichia-Shigella,Enterococcus、Clostridiumsensustricto1和BifidobacteriumDNA呈高水平趋势（图3D和E）。LEfSe分析显示Enterococcaceae、Lactobacillaceae和Bifidobacteriaceae富集在PDAC患者，Porphyromonadaceae、Corynebacteriaceae和Leptotrichiaceae.富集在胰腺囊肿患者中（图3F）。图3PDAC患者与胰腺囊肿患者十二指肠液细菌群落比较表患者特征：PADCvs胰腺囊肿4、正常胰腺对照与胰腺囊肿患者十二指肠微生物比较年龄相匹配的胰腺囊肿患者与正常胰腺对照相比十二指肠细菌DNA水平差异不显著。胰腺囊肿患者Alpha多样性低于健康对照组，beta多样性差异显著，门水平、属水平和LEfSe差异分析并未得到差异菌。5、十二指肠真菌微生物在PDAC患者和对照组中十二指肠液真菌DNA浓度低于细菌DNA浓度（图A）。与正常胰腺对照组和胰腺囊肿患者相比，PDAC患者的真菌DNA水平更高。与正常胰腺对照组相比，PDAC患者真菌alpha多样性指数Faith’sPD显著降低（图4A），beta多样性也存在显著差异（图4B-C）。患者不同组真菌微生物相对丰度分析，门水平发现与正常胰腺对照组相比PDAC患者Asomycota丰度高（图4D-E）。LEfSe分析显示在PDAC患者中属水平Nakaseomyces和Skeletocutis富集（图4F）。图4PDAC患者与正常胰腺对照十二指肠液真菌比较6、胰腺和十二指肠组织细菌和真菌组成总体来说，胰腺肿瘤中的细菌属水平比十二指肠液中的少，而且在胰腺癌组织中检测到的细菌属在十二指肠液中却检测不到。7、十二指肠微生物与PDAC患者生存本文比较了短期存活者和长期存活者在75百分位生存分界点的细菌概况。在属水平上，调整多重比较校正后，短期存活者的十二指肠样本中Fusobacterium、Rothia和Neisseria显著增加。

总结

本研究通过微生物多样性检测技术发现十二指肠液微生物组和胰腺癌患者体内的菌群变化，十二指肠微生物组谱可用于更好地对胰腺癌分层和胰腺癌患者预后风险监测和辅助诊疗。百迈客已经同国内余家科研单位进行合作，具有丰富的项目经验，每年微生物多样性项目00+，宏基因组项目0+，细菌完成图项目+，真菌精细图+。不仅如此，百迈客医学还提供全长微生物多样性检测（PB-MCD）,三代全长扩增子测序技术可鉴定细菌16s全长多样性和真菌18s、TSI全长多样性，实现“种”水平精准注释，全面突破助力科研新高度，同时微生物多样性云平台全面开放，主流程个性化均免费分析。百迈客医学科研服务事业部，是您值得信任和托付的团队，我们将竭诚为您服务，期待与各位老师在今后的日子携手合作，相信百迈客出品，必是精品。

文：TL

排版：市场部

往期回顾：微生物与转录组联合应用微生物组与代谢组联合应用方向大样本量微生物多样性研究思路预览时标签不可点收录于话题#个上一篇下一篇